发酵工程，是采用现代工程技术手段，利用微生物的某些特定功能，为人类生产有用的产品，或直接把微生物应用于工业生产过程的一种技术。在食品工业上的应用主要有三大类产品，一是生产传统的发酵产品，如啤酒、果酒、食醋等；二是生产食品添加剂；三是帮助解决粮食问题，因此A项正确。基因工程是以分子遗传学为理论基础，以分子生物学和微生物学的现代方法为手段，将不同来源的基因按预先设计的蓝图，在体外构建杂种DNA分子，然后导入活细胞，以改变生物原有的遗传特性、获得新品种、生产新产品。胰岛素是治疗糖尿病的特效药，而利用基因工程将合成的胰岛素基因导入大肠杆菌，每2000L培养液就能产生100g胰岛素，打破了传统生产的瓶颈，因此B项正确。细胞工程的主要研究内容有细胞融合(新的物种或品系、单克隆抗体)，细胞核移植(无性繁殖、克隆动物)，染色体工程(多倍体育种)，胚胎工程(试管婴儿)等，因此C项正确。酶工程就是将酶或者微生物细胞、动植物细胞、细胞器等在一定的生物反应装置中，利用酶所具有的生物催化功能，借助工程手段将相应的原料转化成有用物质并应用于社会生活的一门科学技术。在医学上运用酶解法用大豆生产大豆多肽和用水产蛋白生产降血压肽属于酶工程，不属于微生物工程，因此D项错误。故本题答案为D。